مستند مسابقه فرمانده در سری سوم شامل فازهای مختلفی است که مرحله نهایی آن در جزیره فارور ساخته شد؛ ۱۰ شرکت کننده که مراحل سخت و دشوار را برای برگزیده شدن پشت سر گذاشتند و اینک در مرحله پایانی، باید آیتم‌های سخت‌تری را تجربه کنند.
بیشتر این آیتم‌ها برگرفته از آموزش‌های مربوط به تکاوران نیروی دریایی هستند و مجموعه مسابقات هم زیر نظر فرماندهان نیروی دریایی سپاه برگزار می شود و در انتها نیز همین فرماندهان نظامی، امتیازها را بین شرکت کنندگان تقسیم می کنند آن هم بر اساس کیفیت و پایداری هر یک از آنها در انجام مراحل مسابقه.
سری سوم فرمانده شامل آیتم‌های جذاب‌تری همچون تفنگداری دریایی، تیراندازی، چتربازی، عملیات نجات است.